Di dalam memastikan perancangan kegunaan dan pembangunan tanah dilaksanakan secara optimum, Jabatan mempunyai beberapa fungsi utama sebagaimana yang disenaraikan dibawah:-

BAHAGIAN KORPORAT, LEMBAGA RAYUAN DAN TEKNOLOGI MAKLUMAT:
a. Perancangan Korporat dan Lembaga Rayuan
b. Aplikasi Maklumat Perancangan
c. Sistem Maklumat Geografi dan Bank Data

RANCANGAN PEMAJUAN, PENYELIDIKAN, PROJEK KHAS DAN GARIS PANDUAN
a. Rancangan Struktur Negeri, Rancangan Tempatan Daerah dan Rancangan Kawasan Khas
b. Penyelidikan, Garis Panduan / Piawaian
c. Projek Khas

BAHAGIAN KAWALAN PEMBANGUNAN
a. Kawalan Pembangunan Daerah Johor Bahru / IRDA / Kulai / Batu Pahat / Yong Peng / Pontian 
b. Kawalan Pembangunan Daerah Muar / Tangkak / Kota Tinggi  / Mersing / Pengerang
c. Kawalan Pembangunan Daerah Segamat / Labis / Kluang / Simpang Renggam 

BAHAGIAN KHIDMAT PENGURUSAN
a. Pentadbiran
b. Perkhidmatan
c. Kewangan